1.办公室

负责统筹和综合协调全馆性工作；负责行政信息、行政公开、行政接待及公车使用管理、机要保密、业务督办、法务审核、信访维稳、目标考核工作。

2.党群工作部

负责统筹推进全馆党建及党委日常工作，统筹推进全馆党风廉政建设和纪检监察工作；负责统战、工青妇、离退休干部服务及志愿者管理等工作。

3.计划财务部

负责全馆预决算和相关财政资金管理工作；负责政府采购及购买服务、国有资产管理、内部审计工作。

4.组织人事部

负责人才队伍建设规划并组织实施；负责干部培育、选拔、管理、使用等工作；负责人事管理、机构编制及岗位管理、职工教育培训等工作；负责全馆人事、文书、业务档案的收集、整理、保存。

5.后勤保障部（安全保卫部）

负责全馆行政后勤保障和安全保卫、物业管理、工程建设及维保管理；负责固定资产的登记、发放及处置；负责职工食堂运营管理。

6.古籍文献中心（古保中心）

负责馆藏古籍的搜集、整理、保护、流通、利用、开发、研究等工作；负责重庆市古籍保护中心办公室和重庆市古籍保护专家委员会秘书处的日常工作，对全市古籍保护工作进行业务指导、协调及专业培训；负责古籍修复和保护传承工作；负责古籍修复传习所的日常工作。

7.宣传推广中心

负责全馆大型阅读推广活动的策划、组织与实施；负责全馆讲座、展览的策划及管理；负责官方微博、微信等自媒体公众号、客户端建设；负责馆内活动视听资源建设、制作。

8.读者服务中心

负责馆内外文献借阅及阅读推广服务；负责视障读者服务及主题交流活动开展。负责总服务台、读者咨询中心、图书区、报刊、少儿读者、视障人士服务区、自学区的管理工作；负责读者投诉的处理。

9.近代文献中心

负责近代文献的搜集、整理、保护、流通、利用、开发、研究等工作。

10.社会教育中心

负责相关社会教育及馆内场地的运营管理。

11.专题文献中心

负责地方文献、台港澳文献、外文文献的搜集、整理、保护、流通、利用、开发、研究等工作；负责地方文献、台港澳文献、外文文献和联合国文献阅览室、赠书阅览室、基藏书库的日常管理工作。

12.数智技术中心

负责全馆信息技术支撑与保障职责；负责计算机网络系统、应用系统、数据库系统等规划、建设、管理与技术支持；负责各类终端设备的管理与维护。

13.业务研究中心

负责全市公共图书馆业务数据统计及分析报告；负责全市公共图书馆业务的指导、协调及专业人员业务培训；负责信息咨询、科技查新与参考服务工作；负责全馆科研学术建设管理相关工作；负责《图情研究》编辑工作。

14.资源建设中心

负责全馆文献资源（含数字资源）建设、保障与推广职责。负责全馆文献采访与组织、书目数据库建设与维护等工作；负责全市采编中心的日常管理与服务工作。

15.罗斯福图书馆旧址管理中心

负责罗斯福图书馆旧址建设、运营管理工作；负责联合国文献整理、保护、流通、利用、开发、研究等工作。

16.图书馆学会管理中心

负责图书馆学会相关工作；负责科普基地等社会团体工作；负责分馆建设相关工作。